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dmarz ⚡️🤖
observador limitado @ Flashbots
cada día el mundo se vuelve más emocionante, esta es la mejor línea de tiempo

Jorge Bravo Abad12 dic, 19:33
Proteínas diseñadas por IA que sobreviven a 150 °C y fuerzas en nanonewtons
Las proteínas suelen ser máquinas frágiles. Si las calientas, las estiras o las sometes a un paso de esterilización a alta temperatura (como los que se utilizan en hospitales), la mayoría se desdoblarán y se agregarán, perdiendo su función. Sin embargo, muchos sistemas naturales—como la titina muscular o la seda de araña—sugieren que si organizas los enlaces de hidrógeno en lámina β de la manera correcta, puedes obtener una resistencia mecánica y una resiliencia térmica notables.
Bin Zheng y sus coautores toman esa idea y la llevan al extremo. Partiendo del dominio I27 de la titina, utilizan un pipeline de IA+MD—RFdiffusion para la generación de la cadena principal, ProteinMPNN para el diseño de secuencias, ESMFold/AlphaFold2 para la predicción de estructuras, y MD guiado/recocido para la selección—para alargar sistemáticamente las cadenas β que soportan fuerza y maximizar los enlaces de hidrógeno en la cadena principal en una geometría de corte.
A través de múltiples rondas de diseño, hacen crecer la red de 4 a 33 enlaces H en la cadena principal, creando una serie de proteínas “SuperMyo” con fuerzas de desdoblamiento superiores a 1,000 pN—aproximadamente 4 veces más fuertes que I27 bajo las mismas condiciones de tracción. Notablemente, estas proteínas no solo se vuelven a plegar después de la fuerza, sino que también retienen su estructura y función después de ser expuestas a 150 °C y ciclos repetidos de esterilización a alta temperatura, y pueden ser utilizadas como agentes de entrecruzamiento para hacer hidrogeles que sobreviven a esos tratamientos intactos.
El mensaje es poderoso: al combinar el diseño generativo de proteínas con simulaciones basadas en física, ahora es posible convertir un principio simple—empaquetar tantos enlaces de hidrógeno en modo de corte como sea posible en láminas β—en proteínas y materiales sintéticos que rivalizan o superan los propios sistemas mecanostables de la naturaleza, permitiendo hidrogeles y biomateriales a base de proteínas que permanecen funcionales en condiciones que normalmente destruirían proteínas convencionales.
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Un gran respeto a @fede_intern por su capacidad de ver más allá del tribalismo ❤️ pocos líderes en el espacio como él

Fede’s intern 🥊5 dic, 00:51
I recently met @tzhen from @flashbots_x.
I have huge respect for what she’s built and for the research her team is doing.
We can’t work together right now since @class_lambda has a defined strategy in the MEV pipeline space. But long term, I genuinely believe there are multiple ways we can collaborate in ways that benefit @ethereum blockbuilding and MEV world. First I want Lambda and our team to be in a position of power to be able to defend the values we believe in. We also want to teach some lessons to some people that threw some punches to us.
Many male founders I know in the industry talk shit about us without ever having spoken with us. Tina not only showed up, she insisted on meeting multiple times and clearly articulated her position. We talked about the EF, Ethereum core dev, block building and @ethrex_client.
She came to meet ys even knowing if we had some relevant disagreements. I have enormous respect for that. We need more people with the courage to talk to build bridges between different parties. Even if we disagree, and even if we might compete in certain areas, I will always support strong women leaders like her. We need more of them, we have too many cowardly men in this industry.

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